文题释义:
背景:m6A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚。
结果与结论:①从数据集中共筛选出2 460个差异表达的基因,其中1 455个上调,1 005个下调。②从数据集中筛选出了14个m6A-DEGs,包括3个下调和11个上调基因,m6A-DEGs在激素性股骨头坏死中的表达具有显著差异(P < 0.05),Spearman分析表明它们之间具有一定相关性。③m6A-DEGs的GO和KEGG富集分析主要集中在骨髓细胞分化与发育、免疫受体与细胞因子受体活性、破骨细胞分化、AMPK与白细胞介素17信号通路。④m6A-DEGs前7个核心基因包括YTHDF3,YTHDF1,YTHDF2,ALKBH5,METTL3,HNRNPA2B1及HNRNPC,它们在miRTarBase,miRDB和TargetScan数据库中共有44个miRNA重叠,在ChIPBase及hTFtarget数据库中共有79个重叠转录因子。⑤在GSE74089数据集中有6个核心m6A-DEGs的表达水平与GSE123568数据集一致。⑥结果证实,根据生物信息学方法筛选的7个m6A-DEGs可能通过调控多个miRNA、转录因子和AMPK及白细胞介素17信号通路表达,进而影响激素性股骨头坏死中骨髓细胞分化发育与破骨细胞分化,为进一步深入研究激素性股骨头坏死的发病机制和靶向治疗提供了数据支持和研究方向。
https://orcid.org/0000-0003-2588-5506 (令狐熙涛);https://orcid.org/0000-0001-8308-4710 (黄帅)
中国组织工程研究杂志出版内容重点:人工关节;骨植入物;脊柱;骨折;内固定;数字化骨科;组织工程
背景:脊柱侧弯主要指脊柱冠状位、矢状位和轴位上的序列异常,且Cobb角≥10°。脊柱侧弯患者会出现双肩不等高、背部不对称等症状,严重者可能会影响患者心肺功能,从而影响患者的日常生活。保守治疗可以控制其侧凸进展,避免后期手术。脊柱侧弯矫形器是目前保守治疗中较为有效的治疗措施。
结果与结论:①目前脊柱侧弯矫形器文献数量仍处于波动上升趋势。中国和美国是主要研究国家,两者文献占比超过40%,但中国学者的外文文献平均引用率较低。②国内研究的基础领域主要为外科学与儿科学,而在国外主要研究领域是矫形学与临床神经学。国内中医学也有一定数量的文献,说明国内也从事中西医结合的方法治疗脊柱侧弯。国家自然科学基金在中外文献中的占比都是最高的,体现出该基金对脊柱侧弯矫形器研究的重视。③中外文献发文量最高的作者为邱勇和 Negrini Stefano,发文最多的机构是南京大学医学院附属鼓楼医院脊柱外科和UDICE-French Research University。国内外作者及机构有一定交流,但不密切,需要相关机构和学者进行进一步探讨研究。④从研究热点及未来趋势来看,主要治疗类型为青少年特发性脊柱侧弯,脊柱侧弯矫形器制作方式为 3D 打印,主要治疗指标为侧凸进展,治疗最终目的为提升患者的生活质量。
https://orcid.org/0000-0001-8501-5321 (袁艳丽)
背景:脊髓损伤危害严重,损伤后步行功能障碍最影响患者的日常生活能力,在该领域运用外骨骼机器人开展辅助步行康复研究日趋活跃。
结果与结论:①共纳入544篇高质量文献,近10年该领域发文量、总被引频次呈增长趋势;②发文量排名前3的国家依次是美国、中国、意大利,发文量排名前3研究机构是美国退伍军人事务部、美国退伍军人健康管理局、瑞士联邦理工学院;③被引文献频次最高(167次)和中介中心性最高(0.13)的作者均为美国宾夕法尼亚Esquenazi A团队,在该领域具有较高影响力;④对被引频次、中介中心性前5共被引文献分析显示:目前针对脊髓损伤患者配备动力外骨骼设备步行康复研究重点包括在机构、家庭等真实环境中步行康复训练安全性判断、优势分析、个体化培训计划设计,动力外骨骼设备应用于胸椎及以下节段运动功能完全丧失脊髓损伤患者辅助步行效果优劣、影响因素及应用潜力等;⑤近年该领域研究热点集中于个体化(individuals)、步态(gait)、动力外骨骼( powered exoskeleton)、减重支持(body weight support)、功能性电刺激(functional electrical stimulation)、康复(rehabilitation)、辅助技术(assistive technology)、步行活动(ambulation)、恢复(recovery)等内容;⑥该领域研究早期多应用于脑卒中患者,前沿包括减重支持、往复式步态矫形器及功能性电刺激等技术手段,脊髓损伤外骨骼机器人辅助步行康复研究近年呈现上升趋势,关注点逐渐向以适应性控制为机制的医用下肢外骨骼设备研制、安全性提升、应用潜力挖掘等前沿方向转变,研究检测手段注重联合功能性近红外光谱成像等高端技术,而关注患者生活质量、提升运动训练能力及改善机体结构为该领域未来的研究热点。
https://orcid.org/0000-0001-7829-6989(许轶);https://orcid.org/0000-0003-2664-8254(邓宇斌)
背景:铁死亡与骨关节炎发生、发展密切相关,但具体特征基因及调控机制尚不清楚。
结果与结论:①经批次校正及PCA分析获得骨关节炎基因12 548个,同时获得铁死亡基因484个,进而得到24个骨关节炎铁死亡差异基因;②GO分析主要涉及对氧化应激反应、对有机磷反应等生物过程;涉及细胞顶端、顶端质膜等细胞组分;涉及血红素结合、四吡咯结合等分子功能;③KEGG分析显示,骨关节炎铁死亡差异基因与白细胞介素17信号通路、肿瘤坏因子信号通路等信号通路有关;④运用WGCNA分析及机器学习筛选后获得特征基因KLF2;通过基因芯片验证后发现实验组半月板组织中KLF2基因表达高于对照组(P=0.000 14);⑤体外细胞实验显示,骨关节炎组软骨细胞中Ⅱ型胶原、KLF2基因表达低于对照组(P < 0.05),同时在骨关节炎铁死亡中肥大细胞与树突状细胞密切相关(r=0.99),KLF2与自然杀伤细胞(r=-1,P=0.017)、滤泡辅助性T细胞(r=-1,P=0.017)等密切相关;⑥结果显示,运用WGCNA分析及机器学习方法证实KLF2可作为骨关节炎铁死亡的特征基因,可能通过干预KLF2来改善骨关节炎铁死亡。
https://orcid.org/0009-0001-5279-2252 (徐文飞)
背景:随着人工智能技术在治疗脊柱畸形领域的不断完善与进步,已有大量的研究投入到该领域当中,但主要研究现状、热点和发展趋势尚不明确。
结果与结论:①共纳入文献165篇,此领域年发文量呈波动上升趋势,发文量最多的作者是Lafage V,发文量最多的国家是中国。②关键词分析结果显示,青少年早发性脊柱侧弯、深度学习、分类、精度和机器人是该研究领域的主要高频关键词。③文献共被引和高被引文献深度分析结果显示,人工智能在脊柱畸形领域有3大热点,包括利用U型架构(深度学习卷积神经网络的一种成熟模式)来自动测量影像学参数(Cobb角、棘旁肌准确分割等)、多视图相关网络架构(即脊柱曲度评估框架)及机器人引导脊柱手术。④在人工智能治疗脊柱畸形领域,基因组学等机制研究十分薄弱,未来可利用无监督分层聚类等机器学习技术,运用全基因组关联分析等基因组学研究方法,来进行脊柱畸形领域的易感基因等基础机制研究。
https://orcid.org/0009-0005-0611-7300(陶广义);https://orcid.org/0009-0000-2432-5991(黄俊卿)
背景:青少年特发性脊柱侧凸是最常见的脊柱侧凸畸形,占所有脊柱侧凸的80%左右,其发病机制不明,近年来发病率呈明显上升趋势,严重威胁着青少年的身心健康。
结果与结论:共纳入文献5 245篇,近20年该领域年发文量总体呈波动上升趋势。对合作网络分析可知,发文量最多的作者是邱勇、机构是南京大学、国家是美国,而中介中心性最高的作者是Lowe TG、机构是费城儿童医院、国家是瑞士。共被引网络分析可知,被引频次最高的作者是Lenke LG、文献是Weinstein SL(2013,《N Engl J Med》)、期刊是《Spine》,而中介中心性最高的被引作者是Suk SI、被引文献是Danielsson AJ(2001,《Eur Spine J》)、被引期刊是《Spine》。关键词分析可知研究热点主要集中在保守治疗方式,影像学参数,发病机制和全基因组关联等方面的研究。通过对青少年特发性脊柱侧凸研究领域的文献进行可视化分析,为该领域的研究理清了脉络,并揭示了该领域的研究热点和趋势,给众多学者提供了研究思路和方法。
https://orcid.org/0000-0001-7151-3610 (侯召猛)
背景:缺氧与骨关节炎软骨细胞损伤的发生、发展密切相关,但具体作用靶点及调控机制尚不清楚。
结果与结论:①经批次校正及主成分分析获得骨关节炎基因8 492个,主要与Macrophages M2和Mast cells resting等免疫细胞密切相关;同时获得缺氧基因200个,进而得到41个骨关节炎缺氧差异表达基因。②GO分析主要涉及对营养水平、糖皮质激素反应等生物过程;涉及溶酶体腔、高尔基内腔等细胞组分;涉及14-3-3蛋白结合、DNA结合转录激活剂活性等分子功能。③KEGG分析骨关节炎缺氧差异表达基因与PI3K-Akt、FoxO及癌症中的微小RNA等信号通路有关。④运用WGCNA分析及机器学习筛选后获得特征基因KDELR3。⑤通过基因芯片验证后发现KDELR3基因在滑膜中实验组基因表达高于对照组(P=0.014),而半月板中实验组基因的表达却低于对照组(P=0.024)。⑥体外软骨细胞实验显示KDELR3基因在软骨中实验组表达高于对照组(P=0.005),同时KDELR3基因与Macrophages M0(P=0.014),T cells follicular helper(P=0.014)等密切相关。运用机器学习方法证实KDELR3可作为骨关节炎缺氧特征基因,可能通过改善缺氧来干预骨关节炎发病,期待能为更好地治疗骨关节炎提供新方向。
https://orcid.org/0000-0001-5279-2252 (徐文飞);https://orcid.org/0009-0006-1006-7374 (段戡)
背景:椎间盘退变早期诊断和治疗尤为重要,髓核细胞焦亡在早期椎间盘退变过程中发挥着重要作用,但髓核细胞焦亡相关分子在早期椎间盘退变中发挥的作用及相关分子标志物仍不明确。
结果与结论:①获得4 426个与椎间盘退变相关的差异表达基因,交集后获得14个差异表达的焦亡相关基因;②基因本体论、京都基因和基因组百科全书分析揭示了重要的富集途径,主要与炎症、细胞周期、感染和NOD样受体通路相关;基因集富集分析显示氨基酸代谢、P53转录调节等通路在椎间盘退变患者中显著富集;免疫浸润分析提示椎间盘退变的发生发展与免疫细胞密切相关;③共筛选出5个Hub基因,分别为IL-1β、Caspase-1、AIM2、Caspase-5、NLRC4;④椎间盘退变关键生物标志物的获取及鉴定:将GEO两个数据集与焦亡基因取交集后发现NLRP3具有显著表达差异,受试者工作特征曲线显示NLRP3具有临床诊断意义;⑤qRT-PCR显示IL-1β、Caspase-5和NLRC4等Hub基因在椎间盘退变的髓核细胞中表达显著增加(P < 0.05),Caspase-1、AIM2以及NLRP3表达无差异(P > 0.05);⑥提示细胞焦亡在椎间盘退变发生发展过程中发挥重要作用,其中焦亡相关基因NLRP3、IL1-β、Caspase-5、NLRC4具有早期诊断和治疗价值。
https://orcid.org/0000-0002-2746-082X (谢越)
背景:现如今由运动损伤或车辆创伤引起的后交叉韧带损伤比人们想象的更常见,后交叉韧带重建是其主要治疗方式之一,而目前后交叉韧带重建的手术方式和韧带选择尚存在大量争议。
结果与结论:共纳入664篇文章。①在过去的22年里,后交叉韧带重建文章的数量总体上呈上升趋势。前3个国家(美国、中国和韩国)占所有发表文章的65.51%,美国的文章数量最多。University of Pittsburgh是最大的贡献者。《Knee Surgery Sports Traumatol Arthrosc》和《American Journal of Sports Medicine》是最有影响力的杂志。Laprade, Robert F是在后交叉韧带重建领域发文量最多的教授,Fanelli,GC是在后交叉韧带重建领域总链强度最高的教授。②研究方向可分为以下5个组别:“后交叉韧带解剖及生物力学研究”“ 后交叉韧带重建的预后、结果和并发症”“后交叉韧带重建方式与肌腱选择”“手术技术”和“后交叉韧带撕裂联合多韧带损伤”。③提示:从往年的趋势来看,未来将有越来越多与后交叉韧带重建有关的文献发表。在后交叉韧带重建领域,美国处于世界领先地位,中国和韩国则呈现出巨大的潜力。后交叉韧带解剖及生物力学研究、后交叉韧带重建方式与肌腱选择、后交叉韧带撕裂联合多韧带损伤可能是未来后交叉韧带重建研究领域的热点。
https://orcid.org/0009-0002-9150-7423 (葛昊)
文题释义: 关节假体周围感染:中医学领域中归属于“附骨疽”的范畴,是由邪毒侵袭手术部位,热毒壅滞,气血凝结,经络阻滞,进而化腐成脓,流注于筋肉,渗出于体表皮肤所致。 金银花:自古被誉为清热解毒、疏散风热之良药,主治温病发热、热毒血痢和痈疽疔毒等热毒性疾病。 背景:有研究表明金银花、黄连中多种单体治疗关节假体周围感染有效,关于金银花、黄连单独作用的研究较多,但金银花-黄连的共同药理作用机制鲜有文献报道。 目的:基于分子对接和网络药理学手段探究金银花-黄连治疗关节假体周围感染的潜在有效成分、靶点和作用机制。 方法:通过传统中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选金银花、黄连的有效成分和靶点基因。使用人类基因数据库(GeneCards)和在线孟德尔遗传数据库(OMIM)获得关节假体周围感染靶点基因,取交集后获得金银花-黄连与关节假体周围感染的交集基因。通过STRING数据库构建靶点蛋白质之间相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.2软件中“CytoNCA”插件对该PPI网络做拓扑分析和核心靶点筛选,再通过Cytoscape 3.7.2软件构建“中药-有效成分-交集靶点-疾病”“有效成分-交集靶点”和“通路-富集基因”网络。利用DAVID在线工具进行交集靶点的基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过分子对接验证有效成分与靶点亲和力。 结果与结论:①通过数据库筛选获得金银花治疗关节假体周围感染的有效成分14个及对应靶点183个,黄连治疗关节假体周围感染的有效成分9个及对应靶点158个;②共获得关节假体周围感染相关基因286个,药物和疾病的交集基因37个,PPI网络筛选出白细胞介素6等17个核心基因;③GO功能富集显示,金银花-黄连治疗关节假体周围感染的生物功能共有59个,其中生物过程44个,细胞组分6个,分子功能9个;④KEGG通路富集共筛选出17条信号通路;⑤分子对接结果显示,槲皮素、木犀草素、山柰酚与白细胞介素6、基质金属蛋白酶9、白细胞介素1β具有良好的亲和力;⑥结果证实,金银花-黄连治疗关节假体周围感染的具体机制涉及槲皮素和木犀草素等多个有效化合物,南美锥虫病和肿瘤坏死因子信号通路等多个作用途径,白细胞介素6和前列腺素内过氧化物合酶2等多个靶点基因,这些化合物、靶点基因和途径可共同协调药物发挥治疗作用。此外,文章还发现了潜在有效成分槲皮素,为后续深入研究提供了新导向和新思路。
文题释义: 创伤性骨关节炎:是由创伤所导致的一类骨关节炎,可由骨折、关节软骨损伤、关节脱位、半月板及韧带损伤引起,是运动医学领域常见病,可严重影响到患者的运动功能和生活质量。 CiteSpace:是陈超美博士开发并应用于科学文献可视化分析的软件,在国内外众多领域均得到广泛应用。CiteSpace具有“图”和“谱”的双重性质与特征,可对研究文献通过一系列可视化图谱的绘制与分析从而形成对学科演化动力机制的分析和学科发展前沿热点的探测。 背景:创伤性骨关节炎是运动医学领域多发病及常见病,国际上对其研究逐年递增,但中国对其研究现状、研究力量、研究热点与趋势的研究还比较缺乏。 目的:运用Citespace可视化分析软件绘制知识图谱并结合文献探究目前关于创伤性骨关节炎领域的研究热点、研究思路、研究力量分布及其研究主要内容,以期为后续研究该领域的专家学者提供思路和借鉴。 方法:基于CiteSpace可视化分析软件在Web of Science核心合集数据库中以“traumatic arthritis”“post traumatic arthritis”和“traumatic osteoarthritis”为关键词,检索2010-01-01/2020-03-24相关研究文献进行可视化分析及科学知识图谱的绘制,综合图谱和数据结果并结合文献对发文量、研究学科分布、主要研究力量、研究热点及研究文献等进行分析讨论。 结果与结论:①创伤性骨关节炎的研究逐渐受到学者的关注和重视,近10年文献呈总体上升趋势,研究力量以西方发达国家为主,其中美国处于绝对领先地位;②在研究学科上主要以骨科学、风湿病学及外科学等学科为主且呈多学科研究趋势;在研究成果上主要由北美发达国家的研究机构和学者占主导地位;中国学者在该领域发文量仅次于美国,但学术影响力上相对较低;③通过关键词、突现性关键词和文献共被引聚类关键词可知,创伤性骨关节炎的研究热点主要包括前交叉韧带损伤、软骨细胞和膝关节损伤等方面;研究切入角度较多,功能重建术后、前交叉韧带损伤及创伤后骨关节炎发生发展机制、预防及治疗靶点是当前该领域文献研究的主要切入点,此外膝关节和关节软骨是当前创伤性骨关节炎研究的主要研究部位;④文章通过对近11年研究文献的分析可知,早期发现并干预创伤性骨关节炎,防止或延迟创伤性骨关节炎进展,靶向治疗的具体临床应用以及完善标准化、量化的创伤性骨关节炎评估技术是其今后的研究方向。
https://orcid.org/0000-0002-2167-590X (任文博)
文题释义: 生物3D打印技术:广义上包括直接服务于生物医疗行业的3D打印技术;狭义上为利用含细胞的“生物墨水”打印活性结构的过程,即利用活细胞、生长因子、人工生物材料等“生物墨水”精准可控地打印具有生物功能的组织和器官。 精准医学:是将个体基因、环境与生活方式等个体差异考虑在内的疾病治疗与预防的新兴方法,可使医生更准确地预测特定人群的特定疾病的治疗和预防策略。 背景:生物3D打印技术已经广泛应用于生物医学的多个领域,但其成功转化为临床试验的案例并不多,且在精准医学领域仍处于发展阶段。该技术在实现个体化医疗、改变现有的治疗流程、帮助制药和医疗公司研发出更精准的药物方面展现出巨大的潜力,并有望实现从个体化信息采集和诊断到个性化医疗产品制备和精准治疗方案的闭环。 目的:分析生物3D打印技术在精准医学领域研究现状及热点。 方法:检索2015年1月至2020年8月Web of Science数据库核心合集和万方数据库中有关3D打印技术在精准医学领域的文献。利用大数据分析工具、数学统计、计算机语义分析、可视化软件以及数据库分析检索功能对检索结果进行科学计量分析。 结果与结论:①3D打印技术在精准医学领域的研究在2015至2020年的发文量逐年增加;②美国的发文量最多,且其与其他国家的合作也处于核心地位;中国在此领域的研究也较活跃;③近5年全球发表论文最多的研究机构是美国加州大学体系,而中国科学院和上海交通大学是在国际和国内发文量最多的中国科研机构;④《Biofabrication》和《中国组织工程研究》则是国际和国内发文量最多的期刊;⑤全球范围生物3D打印技术在精准医学中的研究热点主要包括生物墨水、微流控、矫形外科、组织/器官再生、药物研发等;国内中文期刊发表的研究成果主要集中在骨科、组织工程、临床教学、医学模型等领域;⑥生物3D打印作为最具有革命性和影响力的先进工具之一,在再生医学及器官移植方面取得了一定成果,在组织工程、干细胞、癌症等领域也成为了优秀的科研工具,并且以数字化手段打造出一条从医学成像、术前规划到植入物设计和制造的精准医学通路。 https://orcid.org/0000-0001-7610-8585 (潘璇)
文题释义: 3D打印技术:是一种增材制造快速成型技术,以数字模型文件为基础,运用粉末状金属、陶瓷和高分子等可黏合材料,通过逐层打印的方式来构造物体。随着生命科学与制造科学的发展,3D打印在生物医学领域也获得了广泛应用研究。 VOSviewer:是一款文献分析和知识可视化软件,分析功能较为全面,如共词分析、共被引分析和合作网络分析等,且分析文献数据量大,通过绘制科学知识图谱将其结果进行可视化展示,可用于展现某研究领域的研究结构及研究热点。 背景:近年3D打印技术在各个领域广泛应用,在医学领域的应用也日趋增多,为医学研究的发展提供了新的方向。 目的:对近5年生物医学领域3D打印的相关文献进行可视化分析,探讨该领域的研究现状、热点和发展趋势。 方法:检索PubMed数据库获取2015至2020年关于生物医学领域3D打印的相关文献,并通过文献PMID号在web of science核心集数据库获取这些文献的引用数据。用文献计量学方法对来源数据进行统计分析,利用VOSviewer软件对作者、机构、国家/地区及关键词进行分析,并绘制可视化图谱。 结果与结论:①共纳入3 471篇文献,近5年论文数量呈逐年上升趋势,根据指数趋势线可预测,发文量将保持增长,未来生物医学领域3D打印的研究将持续受到研究者关注;②共确定22种核心期刊,JCR分区Q≥2以上的期刊占比81.8%,期刊质量级别较高;③根据关键词共现聚类结果可把目前医学领域3D打印的研究方向分为临床应用、组织工程支架、药物制剂领域的应用和3D生物打印共4类;④VOSviewer可视化知识图谱分析显示,3D打印组织工程支架的材料选择和微观结构设计是近年研究热点,是拓展组织工程在临床应用的基础;⑤支架材料呈现出从单一同种向多种复合的发展趋势,支架的三维微观结构,包括孔隙率、孔径和相互连接的孔结构,在增强细胞活力和促进组织生长方面发挥着关键作用;⑥制备具有细胞活性的生物墨水是3D生物打印研究重点,具体热点包括:水凝胶、海藻酸盐和细胞外基质等生物支架材料性能、支架材料的交联和刚度以及干细胞打印等;⑦在3D打印药物制剂领域的应用方面,通过药物制剂打印技术、聚合物、纳米粒子和微流控芯片等热点研究,可实现药物释放系统的个性化设置。
https://orcid.org/0000-0002-5707-6634 (宋涯含)
文题释义: 桃红四物汤:源自于清•吴谦著作《医宗金鉴》,在补血活血之四物汤基础上加以桃仁、红花,使补血而不留瘀,去邪而不伤正。 网络药理学:基于系统生物学理论对生物系统网络进行分析,从成分-靶点-通路进行整体预测及阐明药物在体内作用机制。 背景:桃红四物汤治疗关节置换后假体周围感染具有良好的效果,同时可改善关节活动功能,但目前研究多针对该方中单味药及其成分的抑菌作用,对复方及其他机制的研究甚少。 目的:探究桃红四物汤治疗假体周围感染(PJI)的作用机制。 方法:通过传统中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选桃红四物汤中桃仁、红花、熟地、白芍、当归、川芎的活性成分和靶基因,并在人类基因数据库(GeneCards)获得假体周围感染靶基因,并使用Cytoscape3.7.2构建“药物-成分-靶点-疾病”网络。将筛选到的关键靶基因导入STRING在线平台,建立蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络。并进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因本体(GO)富集分析,以研究其机制。 结果与结论:①从桃红四物汤中筛选出槲皮素、木犀草素、山奈酚等15个有效活性成分,作用于血管内皮生长因子A、肿瘤坏死因子、白细胞介素6等34个关键基因;②基因本体功能富集显示,桃红四物汤生物学过程和功能集中在生物过程的正向调节、对化学刺激的反应、压力反应、调控细胞凋亡等;③京都基因与基因组百科全书通路富集显示,桃红四物汤治疗假体周围感染主要涉及癌症的通路、AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、炎性肠病和细胞因子-细胞因子-受体相互作用通路等信号通路;④通过网络药理学的方法,发现桃红四物汤能够通过抑制细菌生长以及改善血液流变学的多个角度治疗假体周围感染,这为“活血化瘀”之法在假体周围感染中的运用提供了初步的理论基础,亦为后续试验提供了新思路。 https://orcid.org/0000-0001-8883-0399 (袁家威)
文题释义: 文献计量学:可以根据文献数据库和其特征运用统计学方法定性和定量地评估研究趋势,不仅可帮助学者抓住特定研究领域的发展趋势和研究方向,还可评估期刊、机构、国家在特定研究领域的贡献,也可为制定临床指南提供依据。 可视化分析:主要是指借助于图形化手段清晰有效地传达与沟通信息,其本质是利用计算机图像处理技术进行数据的图像化,直观地表现数据之间的交互关系。 背景:探讨股骨髋臼撞击综合征的研究现状及发展趋势,发现股骨髋臼撞击综合征的研究方向及热点,有助于国内学者把握该领域最新信息并探索最前沿的治疗方向。 目的:探究股骨髋臼撞击综合征的全球研究现状及发展趋势。 方法:在Wed of Science科学引文索引扩展数据库中检索2005-01-01/2020-02-20与股骨髋臼撞击综合征相关的英文文献,运用文献计量方法对收集到的文献进行统计及分析,同时使用VOS viewer软件进行可视化转化,分析股骨髋臼撞击综合征的研究现状及发展趋势。 结果与结论:①共纳入3 158篇文献,股骨髋臼撞击综合征的全球研究发表量逐年增加,其中美国发表数量最多,对全球贡献最大,居第1位(1 659篇),且被引用频次(37 019)及H指数(87)均为最高,中国发文量为43篇,排在第14位,被引用频次为301、H指数为9;②《关节镜及其相关手术》刊出的相关论文数量最多(426篇),远超排名第2(287篇)的杂志《美国运动医学》;伯尼尔大学及特种外科医院是相关研究发表量最多的2个机构;③股骨髋臼撞击综合征的研究主题目前集中在5个方面:流行病学、疾病演变、诊断、治疗方法、预后,其中治疗方法是近年来研究的主要领域,经髋关节镜手术是是目前的研究热点;④从目前股骨髋臼撞击综合征的研究发展趋势分析,对该领域的研究还有很大的探索空间,文献发表数量将不断增加,美国在这一领域保持领先地位,中国需要对其有更深入的研究。近年来的研究方向主要集中在股骨髋臼撞击综合征的治疗方面,经髋关节镜治疗股骨髋臼撞击综合征是目前的研究热点。
https//orcid.org/ 0000-0002-0976-9735(凡一诺)
网络药理学:是基于系统生物学和药代动力学的理论,对生物信息的网络分析,选取特定节点进行多靶点药物分子设计,以多靶点作用、多种信号途径综合分析为特点,旨在预测药物治疗疾病的潜在机制,提高临床研究成功率,减少研究经费的新兴学科。
关节假体周围感染:是人工关节置换术后的一种极具破坏性的并发症,主要由金黄色葡萄球菌等致病菌引起假体周围发生化脓性感染及假体表面形成生物膜为主要特点,临床表现为术口及周围红、肿、热、痛,窦道形成,渗液流脓等。
背景:五味消毒饮在临床中已被用于治疗关节假体周围感染,但因五味消毒饮所含有效成分复杂,其分子作用机制尚不明确。
目的:探究五味消毒饮治疗关节假体周围感染的作用机制。
方法:通过中药系统药理学成分分析数据库(BATMAN-TCM)预测获得五味消毒饮的有效化合物及靶点基因,利用GeneCards和OMIM数据库获得关节假体周围感染疾病的相关靶点基因,取两者交集后得到五味消毒饮-关节假体周围感染疾病交集基因。随后采用STRING在线数据库构建蛋白相互作用网络(PPI),根据度值筛选核心基因。将交集基因输入Cytoscape 3.7.2软件以构建WWXDY-靶点-关节假体周围感染可视化网络图,并借助DAVID在线工具进行交集靶点的基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,探讨其抗关节假体周围感染的作用机制。
结果与结论:①从BATMAN-TCM平台共预测出五味消毒饮的有效化合物37个,作用靶点共914个;从GeneCards和OMIM数据库筛选出关节假体周围感染疾病的相关靶点基因286个;取交集获得药物与疾病交集靶点39个,经筛选得到核心基因16个;②GO分析结果显示,交集靶基因的生物过程主要是趋化因子生物合成过程的正向调控、蛋白激酶B信号、炎症反应、脂多糖媒介的信号通路、细胞因子分泌的负调控参与免疫应答等;分子功能为细胞因子活性、生长因子活性、ICAM-3受体活性、Ⅲ型转化生长因子受体结合、前列腺素-内过氧化物合酶活性;细胞组分为细胞外空间、细胞表面、细胞膜外侧面、胞外区、整合蛋白αL-β2复合体;③KEGG通路富集结果主要涉及类风湿性关节炎、疟疾、细胞因子-细胞因子受体相互作用、南美锥虫病、利什曼病、炎症性肠病、阿米巴病、肿瘤坏死因子信号通路、肺结核、自然杀伤细胞介导的细胞毒性等信号通路;④提示五味消毒饮治疗关节假体周围感染疾病的作用机制呈多个有效化合物、多个作用途径以及多个靶点基因的特点,为后续实验提供了新思路、新方向。