干细胞相关大数据分析 Stem cell-related big data analysis 栏目所有文章列表

(按年度、期号倒序)     一年内发表的文章 |  两年内 |  三年内 |  全部 Please wait a minute... 选择: 下载引用 EndNote Reference Manager ProCite BibTeX RefWorks 显示/隐藏图片 Select 外泌体研究态势和前瞻的计量与可视化分析 郑 颖, 黄珂敏 中国组织工程研究    2024, 28 (13): 2126-2132.   DOI: 10.12307/2023.296 摘要 （220）      PDF （2648KB）（27）    可视化    文题释义： 外泌体：是一类大小40-100 nm具有脂质双分子层膜结构的细胞外囊泡，内含蛋白质、脂质、mRNA、miRNA、DNA等生物分子。 文献计量的可视化分析：文献计量学以文献体系和文献计量特征为研究对象，采用数学、统计学等计量研究方法，研究文献情报的分布结构、数量关系、变化规律和定量管理，进而探讨科学技术的结构、特征和发展规律的一门学科。通过数据可视化工具将大量数据分析结果以图表的方法展现出来，使人们能够快速、轻松地查看理解模式和关系，并发现只使用原始数据表或电子表不会注意到的新趋势。 背景：外泌体在临床诊断和治疗方面的应用前景非常巨大，近年来已经成为生物医学研究的前沿热点之一。 目的：总结国内外外泌体基础研究与技术研发的趋势，为开展相关科技研究与开发提供建议。 方法：通过文献计量学方法和工具，对外泌体研究领域的研发总体态势、研究前沿热点以及未来发展趋势进行了定量分析。 结果与结论：外泌体领域的研发热点随着新工具和方法的应用已经进入高速增长阶段，随着临床转化试验的大量开展，很多新的技术和产品面临进入临床应用与市场。通过国内外对比分析，揭示出中国在该领域的基础研究方面已经取得了较显著的成就，但在自主知识产权拥有、临床技术转化以及监管制度规范管理等方面仍存在薄弱环节，需要未来进一步加强。 https://orcid.org/0000-0001-6503-2212 (郑颖)  中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程 Select 基于Web of Science近十年干细胞治疗心肌梗死的可视化分析 孙宇康, 宋丽娟, 温春丽, 丁智斌, 田 昊, 马 东, 马存根, 翟晓艳 中国组织工程研究    2024, 28 (7): 1143-1148.   DOI: 10.12307/2024.138 摘要 （344）      PDF （3984KB）（161）    可视化    文题释义： 文献计量学：以文献体系和文献计量特征为研究对象，采用数学、统计学、文献学等研究方法，研究一切知识的分布结构、数量关系、变化规律和定量管理，注重量化知识体系，进而探讨科学技术的某些结构、特征和规律的一门学科。 干细胞：是一类具有增殖和分化潜能的细胞，具有自我更新复制的能力，能够产生高度分化的功能细胞。按发育阶段分类，分为胚胎干细胞、胚胎生殖干细胞、成体干细胞，按分化潜能分类，分为全能干细胞、多能干细胞、单能干细胞。 背景：心肌梗死的致死率居高不下，是因为包括药物和手术在内的传统治疗方法无法从根本上修复受损的心肌组织，干细胞由于其自我更新和多向分化潜能为解决这一难题提供了可能。 目的：运用文献计量学分析归纳干细胞治疗心肌梗死领域近十年的研究进展。 方法：检索Web of Science数据库中2012-01-01/2022-12-01发表在SCI-E和SSCI中干细胞和心肌梗死的相关文献，利用EXCEL、CiteSpace和VOSviewer软件对发文量、作者、机构、期刊、国家、关键词等数据进行统计及可视化分析。 结果与结论：核心文献共计3 210篇，年发文总量逐年上升；hausenloy,derek j.是发文量最多的作者，中国是发文量最多的国家，第四军医大学是发文量最多的机构，该领域的研究热点正在从细胞实验和动物实验向临床试验方向转变。近十年来，该领域的研究热度较高，仍有较大的发展前景，应促进国际上、机构间的交流学习，进一步挖掘干细胞在心肌梗死治疗领域的作用。 https://orcid.org/0000-0008-6357-6871 (孙宇康)；https://orcid.org/0000-0008-2324-2826 (翟晓艳)  中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程 Select 外泌体在慢性肾脏病诊疗中的研究热点与趋势 陈冠廷, 张琳琪, 李清茹 中国组织工程研究    2024, 28 (1): 86-92.   DOI: 10.12307/2023.765 摘要 （418）      PDF （15745KB）（39）    可视化    文题释义： 外泌体：本质是具有脂质双层膜结构的球形纳米级小囊泡，其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体，由脂类、蛋白质、核酸组成，其中包含多种重要生物活性分子，可通过受体-配体相互作用、与细胞质膜直接融合或内吞等主要途径将活性成分运输到靶细胞，调控靶细胞生物学功能。 知识图谱：通过汇总某一领域相关文献，用可视化技术描述知识资源及其载体，挖掘、分析、构建、绘制和显示知识及它们之间的相互联系。 背景：探讨外泌体在慢性肾脏病诊疗应用中的研究重点及后续研究趋势，以期为今后外泌体诊疗慢性肾脏病相关研究提供相应的参考依据，促进该领域的发展。 目的：对各数据库建库至今公开发表的外泌体诊疗慢性肾脏病的相关研究进行文献计量分析，探索该学科领域的发展现状及趋势，预测未来研究方向。 方法：计算机检索万方数据库、中国知网、中国生物医学文献数据库、维普网、Web of Science、Cochrane Library、PubMed、Embase数据库自建库至2022年12月公开发表的关于外泌体诊疗慢性肾脏病的相关研究文献，文献题录经NoteExpress筛选后通过Citespace 6.1R4和VOSviewer软件对作者、机构、关键词进行共现、聚类及突现分析，并绘制可视化知识图谱。 结果与结论：①共纳入文献804篇，包括中文文献133篇、英文文献671篇，发文量逐年攀升，趋势迅猛；纳入文献作者3 649位，包括中文作者326位，英文作者3 323位，该领域已形成了以刘必成、王彬、吕林莉、王晓楠、王海东等学者为中心的核心团队，且各机构间已形成稳定的多中心合作平台；研究热点主要聚焦于外泌体的载运、诊断及治疗3个功能。②外泌体作为胞外囊泡的一种，具有携带和转移分子介质与信号转导的重要机制，在慢性肾脏病生理病理发展当中具有重要作用，可为流行病学研究和临床决策提供重要的健康监测数据。近年来关于外泌体诊疗慢性肾脏病相关研究发展迅猛，形成了以中国科研机构为首，全球多机构跨区域协同合作的发展布局。但目前外泌体及内容物在疾病过程中具体功能及作用机制的研究尚未得到充足验证，其对慢性肾脏病的早期诊断及预后评价意义不甚明确，内在作用机制相关研究仍处于相对贫乏阶段，分离与提纯技术仍有待提高，且尚未出现多中心、大样本的高质量循证临床试验，仍需进一步研究加以验证。 https://orcid.org/0000-0003-1207-4325 (陈冠廷)  中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程 Select 干细胞治疗椎间盘退变研究现状和趋势的文献计量学分析 李秋江, 房晓敏, 王胤斌, 胡学华, 蔡利军 中国组织工程研究    2021, 25 (31): 5000-5011.   DOI: 10.12307/2021.143 摘要 （492）      PDF （4220KB）（205）    可视化    文题释义： Citespace：该软件是由美国华裔科学家陈超美博士利用JAVA语言所开发的文献数据挖掘和可视化分析软件，通过提取大量文献的数据进行共现和共被引分析，可对目前研究现状和未来研究热点作出分析和预测。 椎间盘退变：随着年龄的增长椎间盘内髓核组织含水量降低，椎间盘失去了正常的弹性，过度的劳累和负荷常常会加速椎间盘退行性变化的进程，常引起腰腿痛甚至伴有神经功能障碍，严重影响患者的生活质量。 背景：干细胞在椎间盘退变中的治疗一直是研究热点，通过应用文献计量学分析软件对该领域众多文献数据进行共现和共被引分析，可以一定程度上预测和分析该领域的研究现状以及发展趋势。 目的：采用文献计量可视化分析法分析干细胞在椎间盘退变治疗中的研究现状及发展趋势。 方法：通过科学引文索引数据库核心合集检索1999至2020年关于干细胞在椎间盘退变治疗中的文献，采用文献计量学方法对文献数据进行统计分析，并结合Citespace 5.6.R5和VOSviewer 1.6.15软件进行可视化图谱绘制，分析干细胞在椎间盘治疗中的研究现状及发展趋势。 结果与结论：①共纳入613篇文献，干细胞在椎间盘治疗研究中的发文量呈逐年上升的趋势，其中中国和美国分别以发文量232篇和174篇排名前2位；②美国总被引频次(5 522)、h指数(42)和中介中心性值(0.75)位居首位，均高于第2位的中国(3 169，28，0.16)；③共被引排名前10的参考文献分别从多个方面介绍了骨髓间充质干细胞治疗椎间盘退变的研究，其中7篇均与骨髓间充质干细胞髓核样诱导分化有关，2篇涉及椎间盘再生治疗中最佳细胞来源和细胞载体构建，1篇与退变椎间盘再生治疗的临床试验研究有关；④参考文献共被引时间线图表明：以聚类“间充质干细胞”“脊索细胞”“终板”“脂肪来源间充质干细胞”发表的参考文献最多，根据聚类参考文献发表的年份来看，聚类“脊索细胞”“脊索”和“注射”发表的参考文献年份最新；⑤聚类关键词“椎间盘退变”“迁移”“脊索细胞”“京尼平”和“水凝胶”与上述聚类对应，由此印证了当前的研究热点为：间充质干细胞髓核样分化、椎间盘再生治疗中的最佳细胞来源和细胞载体构建和椎间盘再生治疗的临床有效性和生物安全性；⑥同时发现从2017至2019年新出现的突现关键词有5个，分别是“注射”“椎间盘退变”“炎症”“凋亡”“穿刺”，主要集中在细胞凋亡、炎性反应与椎间盘退变的联系以及细胞移植方法学等方面；⑦上述全球趋势分析提示，随着干细胞在椎间盘退变治疗领域发文量的不断增加，相关研究的不断深入，目前研究的热点主要集中于间充质干细胞髓核样分化、椎间盘再生治疗中的最佳细胞来源和细胞载体构建、椎间盘再生治疗的临床有效性和生物安全性方面，而深入探究椎间盘退变的凋亡和炎性反应相关机制和提高细胞移植方法学可能是今后研究的关注点。 https://orcid.org/0000-0003-3123-8145(蔡利军)  中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程 Select 2011至2020年乳腺癌干细胞Web of Science数据库的文献计量学与可视化分析 陆宇云, 黄 梅, 石新蕾, 陈宝艳 中国组织工程研究    2021, 25 (25): 4001-4008.   DOI: 10.12307/2021.011 摘要 （508）      PDF （3721KB）（296）    可视化    文题释义： 乳腺癌干细胞的特性：具有化疗抵抗性、放疗抵抗性、缺氧抵抗性、高致瘤性及高侵袭转移性等特征，在乳腺癌的发生发展以及复发转移中发挥重要作用，成为乳腺癌复发的重要原因，并且与乳腺癌预后相关。 乳腺癌干细胞起源：假说有以下两种，一种是乳腺癌干细胞起源于成体干细胞，通过遗传改变获得恶性行为，另一种是乳腺癌干细胞由早期祖细胞获得了自我更新能力转化而来。 背景：目前人们已认识到乳腺癌干细胞在乳腺癌的发生、发展、转移、复发和产生耐药性等一系列过程中的重要作用，但对乳腺癌干细胞在其中的作用机制仍不明确，因此对乳腺癌的治疗还有待进一步的改善。 目的：探索2011年至2020年乳腺癌干细胞研究领域的研究现状和发展趋势。 方法：从Web of Science数据库获取乳腺癌干细胞研究领域的相关文献数据，用Microsoft Excel 2019软件绘制相应数据的二维条形图，采用VOSviewer软件的共现分析功能绘制关键词共现分析图及其与时间的叠加图。 结果与结论：①共纳入1 013篇文献，美国的发文数量、H指数及被引频数总计均为世界之首；肿瘤学方向的文献数量最多，中山大学是产出文献数量最多的机构；密歇根大学的WICHA MS是发表文献最多的作者，国家自然科学基金支持产出的文献数量最多，在《ONCOTARGET》杂志上刊登的文献数量最多；②肿瘤学研究方面，化疗与二甲双胍的联合治疗、抗血管生成剂的靶向治疗是重点研究内容；③在基因遗传学研究方面，转录因子X2(sox2)、表观遗传调控因子H2(ezH2基因)及胚胎干细胞转录因子(nanog)是重点研究基因；④在乳腺癌干细胞应用于乳腺癌的治疗研究方面，上皮-间充质转化是主要研究内容；⑤在分子生物学研究方面，分化抗体CD24、分化抗体CD44为重点生物标志物；⑥核转录因子κB通路和抗乳腺癌干细胞特性(stemness)是最近出现频率较高的关键词；⑦与核转录因子κB通路相关的重组人受体酪氨酸激酶HRG/ErbB3信号、紫檀芪和双硫仑是研究热点，与乳腺癌干细胞特性相关的上皮/间充质杂质基因、 miR34a-NOTCH1(跨膜受体蛋白)轴、LINC00511/miR-185-3p/E2F1/Nanog轴是重点研究内容；⑧在国家合著分析方面，美国与其他各国的链接强度最高；⑨上述数据说明在乳腺癌干细胞研究领域中，美国处于绝对领先地位；乳腺癌干细胞应用于乳腺癌治疗的研究较为受人关注，而核转录因子κB通路和抗乳腺癌干细胞特性的研究是该领域目前的研究热点。 https://orcid.org/0000-0002-8730-8483(陆宇云)  中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程 Select 间充质干细胞治疗椎间盘退行性疾病：基于Web of Science数据库的文献计量及可视化分析 张 凯, 张晓勃, 施锦涛, 王克平, 周海宇 中国组织工程研究    2021, 25 (19): 3031-3038.   DOI: 10.3969/j.issn.2095-4344.3535 摘要 （329）      PDF （2545KB）（157）    可视化    文题释义： Citespace软件：是基于Java开发的一款文献计量和可视化分析软件，通过对领域内研究文献的作者、摘要、关键词等进行共引分析和寻径网络算法，形成可视化的网络知识图谱和动态变化，用以探索文献正文中的关键路径，并确定特定主题知识的演变过程、分析研究热点和发展趋势。 椎间盘退行性疾病：是脊柱外科常见病，主要病因包括创伤、退变、突出等，其特征是一个或多个椎间盘破裂(退化)，从而导致腰背部疼痛，并常放射至腿和手臂。该病多见于中青年人群且有年轻化趋势，严重影响人们的身体健康和生活质量。 背景：间充质干细胞具有自我更新和多向分化的特性，在治疗椎间盘疾病中具有巨大的潜力和应用前景。 目的：针对间充质干细胞治疗椎间盘退行性疾病相关文献进行文献计量学分析，了解该领域的研究热点、发展趋势，为其后续发展提供依据和建议。 方法：以间充质干细胞治疗椎间盘退行性疾病为主题，检索2000至2019年Web of Science核心合集收录的相关文献，统计文献的年发文量、科研基金资助情况，并采用Citespace 5.5.R2软件分析作者、国家和机构的合作关系、期刊或文献的共被引情况，最后对关键词进行聚类分析、突现分析及时区图分析，并绘制出可视化的知识图谱。 结果与结论：①共纳入648篇文献，文献类型以期刊论文为主要形式；②科研基金以中国和美国资助项目最多(占基金总数的50%以上)；③共纳入作者206位，发文量≥3篇的有70位，主要研究者有Daisuke Sakai(日本)关注间充质干细胞移植治疗椎间盘退变、Judith A Hoyland(英国)关注间充质干细胞对髓核细胞表型的调节、Makarand V Risbud(美国)关注诱导间充质干细胞向髓核细胞分化；④共纳入国家和机构125个，主要国家为中国和美国；⑤共纳入期刊154个，《SPINE》杂志是收录文章最多的期刊；⑥关键词分析显示，该领域研究可分为3个阶段：第1阶段为2005至2012年，主要研究基因表达差异、间充质干细胞软骨分化、椎间盘细胞外基质改变；第2阶段为2012至2017年，主要研究间充质干细胞注射治疗及椎间盘微环境变化；第3阶段为2017至2019年，主要研究细胞疗法及间充质干细胞促进椎间盘再生；⑥结合热点关键词变化，文章预测未来的研究方向为提取培养间充质干细胞并诱导向髓核细胞分化、间充质干细胞旁分泌对椎间盘细胞作用及间充质干细胞结合组织工程技术促进椎间盘再生。 https://orcid.org/0000-0002-3010-6231(张凯) 中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程