干细胞相关大数据分析 Stem cell-related big data analysis 栏目所有文章列表

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    外泌体在慢性肾脏病诊疗中的研究热点与趋势
    陈冠廷, 张琳琪, 李清茹
    中国组织工程研究    2024, 28 (1): 86-92.   DOI: 10.12307/2023.765
    摘要426)      PDF (15745KB)(39)   


    文题释义:

    外泌体:本质是具有脂质双层膜结构的球形纳米级小囊泡,其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,由脂类、蛋白质、核酸组成,其中包含多种重要生物活性分子,可通过受体-配体相互作用、与细胞质膜直接融合或内吞等主要途径将活性成分运输到靶细胞,调控靶细胞生物学功能。
    知识图谱:通过汇总某一领域相关文献,用可视化技术描述知识资源及其载体,挖掘、分析、构建、绘制和显示知识及它们之间的相互联系。

    背景:探讨外泌体在慢性肾脏病诊疗应用中的研究重点及后续研究趋势,以期为今后外泌体诊疗慢性肾脏病相关研究提供相应的参考依据,促进该领域的发展。
    目的:对各数据库建库至今公开发表的外泌体诊疗慢性肾脏病的相关研究进行文献计量分析,探索该学科领域的发展现状及趋势,预测未来研究方向。
    方法:计算机检索万方数据库、中国知网、中国生物医学文献数据库、维普网、Web of Science、Cochrane Library、PubMed、Embase数据库自建库至2022年12月公开发表的关于外泌体诊疗慢性肾脏病的相关研究文献,文献题录经NoteExpress筛选后通过Citespace 6.1R4和VOSviewer软件对作者、机构、关键词进行共现、聚类及突现分析,并绘制可视化知识图谱。

    结果与结论:①共纳入文献804篇,包括中文文献133篇、英文文献671篇,发文量逐年攀升,趋势迅猛;纳入文献作者3 649位,包括中文作者326位,英文作者3 323位,该领域已形成了以刘必成、王彬、吕林莉、王晓楠、王海东等学者为中心的核心团队,且各机构间已形成稳定的多中心合作平台;研究热点主要聚焦于外泌体的载运、诊断及治疗3个功能。②外泌体作为胞外囊泡的一种,具有携带和转移分子介质与信号转导的重要机制,在慢性肾脏病生理病理发展当中具有重要作用,可为流行病学研究和临床决策提供重要的健康监测数据。近年来关于外泌体诊疗慢性肾脏病相关研究发展迅猛,形成了以中国科研机构为首,全球多机构跨区域协同合作的发展布局。但目前外泌体及内容物在疾病过程中具体功能及作用机制的研究尚未得到充足验证,其对慢性肾脏病的早期诊断及预后评价意义不甚明确,内在作用机制相关研究仍处于相对贫乏阶段,分离与提纯技术仍有待提高,且尚未出现多中心、大样本的高质量循证临床试验,仍需进一步研究加以验证。

    https://orcid.org/0000-0003-1207-4325 (陈冠廷) 

    中国组织工程研究杂志出版内容重点:干细胞;骨髓干细胞;造血干细胞;脂肪干细胞;肿瘤干细胞;胚胎干细胞;脐带脐血干细胞;干细胞诱导;干细胞分化;组织工程

    基于Web of Science近十年干细胞治疗心肌梗死的可视化分析
    孙宇康, 宋丽娟, 温春丽, 丁智斌, 田 昊, 马 东, 马存根, 翟晓艳
    中国组织工程研究    2024, 28 (7): 1143-1148.   DOI: 10.12307/2024.138
    摘要354)      PDF (3984KB)(167)   


    文题释义:

    文献计量学:以文献体系和文献计量特征为研究对象,采用数学、统计学、文献学等研究方法,研究一切知识的分布结构、数量关系、变化规律和定量管理,注重量化知识体系,进而探讨科学技术的某些结构、特征和规律的一门学科。
    干细胞:是一类具有增殖和分化潜能的细胞,具有自我更新复制的能力,能够产生高度分化的功能细胞。按发育阶段分类,分为胚胎干细胞、胚胎生殖干细胞、成体干细胞,按分化潜能分类,分为全能干细胞、多能干细胞、单能干细胞。


    背景:心肌梗死的致死率居高不下,是因为包括药物和手术在内的传统治疗方法无法从根本上修复受损的心肌组织,干细胞由于其自我更新和多向分化潜能为解决这一难题提供了可能。

    目的:运用文献计量学分析归纳干细胞治疗心肌梗死领域近十年的研究进展。
    方法:检索Web of Science数据库中2012-01-01/2022-12-01发表在SCI-E和SSCI中干细胞和心肌梗死的相关文献,利用EXCEL、CiteSpace和VOSviewer软件对发文量、作者、机构、期刊、国家、关键词等数据进行统计及可视化分析。

    结果与结论:核心文献共计3 210篇,年发文总量逐年上升;hausenloy,derek j.是发文量最多的作者,中国是发文量最多的国家,第四军医大学是发文量最多的机构,该领域的研究热点正在从细胞实验和动物实验向临床试验方向转变。近十年来,该领域的研究热度较高,仍有较大的发展前景,应促进国际上、机构间的交流学习,进一步挖掘干细胞在心肌梗死治疗领域的作用。

    https://orcid.org/0000-0008-6357-6871 (孙宇康);https://orcid.org/0000-0008-2324-2826 (翟晓艳) 

    中国组织工程研究杂志出版内容重点:干细胞;骨髓干细胞;造血干细胞;脂肪干细胞;肿瘤干细胞;胚胎干细胞;脐带脐血干细胞;干细胞诱导;干细胞分化;组织工程

    外泌体研究态势和前瞻的计量与可视化分析
    郑 颖, 黄珂敏
    中国组织工程研究    2024, 28 (13): 2126-2132.   DOI: 10.12307/2023.296
    摘要227)      PDF (2648KB)(31)   


    文题释义:

    外泌体:是一类大小40-100 nm具有脂质双分子层膜结构的细胞外囊泡,内含蛋白质、脂质、mRNA、miRNA、DNA等生物分子。
    文献计量的可视化分析:文献计量学以文献体系和文献计量特征为研究对象,采用数学、统计学等计量研究方法,研究文献情报的分布结构、数量关系、变化规律和定量管理,进而探讨科学技术的结构、特征和发展规律的一门学科。通过数据可视化工具将大量数据分析结果以图表的方法展现出来,使人们能够快速、轻松地查看理解模式和关系,并发现只使用原始数据表或电子表不会注意到的新趋势。


    背景:外泌体在临床诊断和治疗方面的应用前景非常巨大,近年来已经成为生物医学研究的前沿热点之一。

    目的:总结国内外外泌体基础研究与技术研发的趋势,为开展相关科技研究与开发提供建议。
    方法:通过文献计量学方法和工具,对外泌体研究领域的研发总体态势、研究前沿热点以及未来发展趋势进行了定量分析。

    结果与结论:外泌体领域的研发热点随着新工具和方法的应用已经进入高速增长阶段,随着临床转化试验的大量开展,很多新的技术和产品面临进入临床应用与市场。通过国内外对比分析,揭示出中国在该领域的基础研究方面已经取得了较显著的成就,但在自主知识产权拥有、临床技术转化以及监管制度规范管理等方面仍存在薄弱环节,需要未来进一步加强。

    https://orcid.org/0000-0001-6503-2212 (郑颖) 

    中国组织工程研究杂志出版内容重点:干细胞;骨髓干细胞;造血干细胞;脂肪干细胞;肿瘤干细胞;胚胎干细胞;脐带脐血干细胞;干细胞诱导;干细胞分化;组织工程

    内皮细胞特异性骨形态发生蛋白2对血管新生的影响:生物信息学分析和实验验证
    燕 茹, 王凯茹, 张飞燕, 贾绍斌, 丛广志
    中国组织工程研究    2025, 29 (1): 103-110.   DOI: 10.12307/2024.737
    摘要13)      PDF (1623KB)(2)   

    文题释义:
    生物信息学:利用应用数学、信息学、显著性和计算机科学的方法对生物学实验数据进行分析。研究的基础工具是计算机,研究方法包括对生物学数据的收集和筛选、处理编辑、统计整理、可视化展示及计算模拟等。
    血管新生:又称为血管生成或血管发生,是指在原先存在的血管的基础上生出新的血管的生理学过程。血管新生主要是通过既有血管的出芽与分裂完成的。


    背景:血管新生是心血管疾病的主要干预靶点,骨形态发生蛋白2具有调控血管新生作用,但内皮细胞特异性骨形态发生蛋白2对血管新生的调控作用不清楚。 
    目的:探讨内皮细胞特异性骨形态发生蛋白2对血管新生的影响。
    方法:①生物信息学分析:通过PanglaoDB公共基因表达数据库单细胞转录组荟萃分析观察骨形态发生蛋白2细胞群表达丰度和定位。血管新生小鼠和内皮(心内膜)过表达骨形态发生蛋白2小鼠转录组测序数据集探索内皮细胞骨形态发生蛋白2对血管新生信号通路的调控作用。②体内实验验证:建立小鼠后肢缺血模型,对比模型小鼠患侧与健侧缺血后肢7 ,14 和21 d血流灌注情况,免疫荧光和免疫组织化学染色评估小鼠骨形态发生蛋白2和CD31的表达定位情况。③体外实验验证:体外培养人脐静脉内皮细胞,分为对照组、缺氧组和骨形态发生蛋白2抑制剂(Noggin蛋白)干预组,培养24 h,观察各组内皮细胞血管新生情况。
    结果与结论:①内皮细胞是表达骨形态发生蛋白2的重要细胞亚群,在血管新生内皮细胞和骨形态发生蛋白2过表达内皮细胞转录组再分析均发现骨形态发生蛋白2表达明显升高,血管新生通路明显激活。②缺血7 d小鼠新生血管周围骨形态发生蛋白2阳性血管明显增加(P < 0.05),缺血2周骨形态发生蛋白2阳性血管明显减少(P < 0.001)。③体外培养人脐静脉内皮细胞,缺氧干预后,内皮细胞迁移能力和血管出芽明显增加,血管新生因子血管内皮生长因子和血小板衍生生长因子的表达明显升高,Noggin明显减少了缺氧诱导的内皮细胞血管新生(P < 0.001),并下调血管内皮生长因子和血小板衍生生长因子的表达(P < 0.01)。④结果证实,内皮细胞特异性骨形态发生蛋白2具有调控血管新生作用,靶向性内皮细胞骨形态发生蛋白2可望改善血管新生。

    https://orcid.org/0009-0009-6519-4604 (燕茹);https://orcid.org/0000-0002-0174-5026 (丛广志) 

    中国组织工程研究杂志出版内容重点:干细胞;骨髓干细胞;造血干细胞;脂肪干细胞;肿瘤干细胞;胚胎干细胞;脐带脐血干细胞;干细胞诱导;干细胞分化;组织工程