设计:随机对照细胞学实验。
时间及地点:实验于2013年6月至2014年3月在解放军兰州军区兰州总医院血液科实验室完成。
材料:TechGene PCR扩增仪、RNA提取试剂盒、反转录试剂盒、质粒提取试剂盒、Taq DNA聚合酶、dNTP、含20 ng MgCL2的Buffer、琼脂糖凝胶电泳仪、胶回收试剂盒均购自Tiangen天根生化科技有限公司。BamHⅠ和TaqⅠ限制性内切酶、T4连接酶购于TakaRa公司。反转录病毒包装系统由Shuo Dong教授(Baylor College of Medicine)惠赠。293T、U266细胞购自中国科学院上海细胞生物学研究所,由解放军兰州军区兰州总医院血液科实验室保存。LB固体培养基,大肠杆菌DH5感受态细胞均由解放军兰州军区兰州总医院血液科实验室提供。NDRG2、β-actin一抗以及相应二抗均购自Santa Cruz公司。
实验方法:
总RNA提取与反转录:按照RNA提取试剂盒说明书操作,提取U266细胞的总RNA,经紫外分光光度计测定纯度和浓度合格后按照反转录试剂盒操作合成cDNA的第一条链,-20 ℃保存以备后用。
引物设计及PCR扩增:根据GeneBank收录的NDRG2基因序列设计1对PCR扩增引物,并设计加入BamHⅠ和TaqⅠ两种酶切位点,引物序列为:上游5’-GAG ATA TGC TCT TAA CCA CCC G-3’,下游5'-GCT GCC CAA TCC ATC CAA-3’,引物送上海生工公司合成。PCR扩增条件:95 ℃预变性5 min,95 ℃ 30 s,59 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,共35个循环,72 ℃延伸1 min。将PCR产物以琼脂糖凝胶电泳分离,切取目的片段产物以胶回收试剂盒进行回收纯化处理。
反转录病毒载体构建:用两种限制性内切酶同时对上步胶回收产物与载体pBabe-puro进行双酶切,酶切体系 20 μL:胶回收产物DNA或载体质粒6 μL,酶BamHⅠ和TaqⅠ各1 μL,缓冲液2 μL,水10 μL(37 ℃,3 h)。酶切后的目的片段和载体DNA经琼脂糖凝胶电泳后,根据正确的碱基片段大小胶回收。将胶回收产物进行连接反应,连接体系10 μL:载体2 μL,目的基因片段6 μL,缓冲液1 μL,T4连接酶1 μL(16℃过夜)。将连接产物转化至大肠杆菌DH5感受态,接种于含氨苄抗性的LB琼脂平板上,37 ℃培养过夜,挑取单克隆菌落,摇菌过夜并抽提质粒。酶切鉴定重组质粒,DNA电泳确定片段大小是否正确,将鉴定正确的克隆送测序进一步确定。最后,选择正确的克隆,培养并提取质粒,-20 ℃保存以备后用。
反转录病毒的制备及滴度测定:将293T细胞以每孔 2×105个(500 μL)接种于24孔板,并以无血清及无抗生素DMEM培养基培养过夜后使得细胞生长密度达到60%-80%;提前提取反转录病毒载体质粒和非特异性对照质粒,并定量备用;按照脂质体使用说明书,将各种质粒与脂质体配比混合后共转染293T细胞;37 ℃、体积分数为5% CO2孵箱中培养18 h后更换完全DMEM培养基继续培养24 h,并收集培养上清;将293T细胞以每孔5 000个接种于6孔板中,培养24 h后每孔加入适量病毒感染48 h,通过流式细胞仪检测293T细胞红色荧光cherry阳性表达率,根据公式计算病毒滴度:滴度(TU/mL)=1×105(293T细胞数)×cherry阳性表达率(%)×100/每孔病毒液的体积含量(μL)。
感染并筛选稳定表达NDRG2的U266细胞:将U266细胞以每孔 2×105个(500 μL)接种于24孔板,正常培养;每孔加入适量病毒感染48 h后使用含嘌呤霉素(4.0 mg)的培养基进行筛选,每3 d更换含嘌呤霉素的完全培养基,直至未被感染的细胞全部死亡时,筛选结束;对筛选克隆换正常培养基扩增培养,即获得稳定表达NDRG2的U266细胞。
Western blot检测NDRG2表达:收集细胞样品,检测NDRG2的蛋白表达水平。提取处理后的细胞总蛋白用含蛋白酶抑制剂的裂解缓冲液充分裂解,然后用BCA法(pierce)进行蛋白定量,取50 µg处理好的蛋白样品行SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,100 V恒压转移2 h后5%脱脂奶粉室温封闭1 h,将NC膜与抗体孵育,4 ℃过夜,TBST缓冲液洗膜3次,每次5 min,加入二抗,室温孵育1 h,再次洗膜3次,每次5 min,利用LI-COR Bioscience的Odyssey Infrared Imaging System对靶分子的蛋白表达水平进行定量化的检测,分析结果。主要观察指标:构建载体的片段大小、病毒的滴度和对细胞的感染情况以及NDRG2在人骨髓瘤细胞U266中的表达。