非编码RNA与间充质干细胞研究的相关计量学分析

doi:10.12307/2025.006

中国组织工程研究 ›› 2025, Vol. 29 ›› Issue (1): 87-94.doi: 10.12307/2025.006

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非编码RNA与间充质干细胞研究的相关计量学分析

周嘉欣，陶疆

上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔综合科，上海交通大学口腔医学院，国家口腔医学中心，国家口腔疾病临床医学研究中心，上海市口腔医学重点实验室，上海市口腔医学研究所，中国医学科学院口腔颌面再生医学创新单元，上海市 200011

收稿日期:2023-11-23 接受日期:2023-12-21 出版日期:2025-01-08 发布日期:2024-05-18
通讯作者: 陶疆，博士，主任医师，博士生导师，上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔综合科，上海交通大学口腔医学院，国家口腔医学中心，国家口腔疾病临床医学研究中心，上海市口腔医学重点实验室，上海市口腔医学研究所，中国医学科学院口腔颌面再生医学创新单元，上海市 200011
作者简介:周嘉欣，女，1997年生，广东省东莞市人，汉族，上海交通大学在读硕士，医师，主要从事非编码RNA与干细胞研究。
基金资助:
国家自然科学基金项目(82170922)，项目负责人：陶疆

A bibliometric analysis of non-coding RNA and mesenchymal stem cell research

Zhou Jiaxin, Tao Jiang

Department of General Dentistry, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine; College of Stomatology, Shanghai Jiao Tong University; National Center for Stomatology; National Clinical Research Center for Oral Diseases; Shanghai Key Laboratory of Stomatology; Shanghai Research Institute of Stomatology; Research Unit of Oral and Maxillofacial Regenerative Medicine, Chinese Academy of Medical Sciences, Shanghai 200011, China

Received:2023-11-23 Accepted:2023-12-21 Online:2025-01-08 Published:2024-05-18
Contact: Tao Jiang, MD, Chief physician, Doctoral supervisor, Department of General Dentistry, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine; College of Stomatology, Shanghai Jiao Tong University; National Center for Stomatology; National Clinical Research Center for Oral Diseases; Shanghai Key Laboratory of Stomatology; Shanghai Research Institute of Stomatology; Research Unit of Oral and Maxillofacial Regenerative Medicine, Chinese Academy of Medical Sciences, Shanghai 200011, China
About author:Zhou Jiaxin, Master candidate, Physician, Department of General Dentistry, Shanghai Ninth People’s Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine; College of Stomatology, Shanghai Jiao Tong University; National Center for Stomatology; National Clinical Research Center for Oral Diseases; Shanghai Key Laboratory of Stomatology; Shanghai Research Institute of Stomatology; Research Unit of Oral and Maxillofacial Regenerative Medicine, Chinese Academy of Medical Sciences, Shanghai 200011, China
Supported by:
National Natural Science Foundation of China, No. 82170922 (to TJ)

摘要/Abstract

摘要：

文题释义：
非编码RNA(ncRNA)：是一类不编码蛋白质的RNA分子，广泛参与调控细胞功能，包括转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、小核RNA(snRNA)和微小RNA(miRNA)等，它们在基因表达、细胞周期和发育等生物学过程中发挥关键作用。近年来，ncRNA的研究引起广泛关注，对于理解疾病发生机制以及开发治疗方法具有重要意义。
文献计量学分析：是一种定量研究方法，通过对学术文献的统计与分析，揭示研究领域的趋势、关键主题和学术合作网络。该方法利用引用、发表频率等数据，评估研究的影响力和重要性。

背景：非编码RNA作为一类不编码蛋白质的RNA分子，在细胞调控中发挥关键作用。同时，间充质干细胞具有多向分化潜能，对组织修复和再生至关重要。近年来，研究者们对非编码RNA在调控间充质干细胞功能中的作用展开了深入探讨。
目的：通过文献计量学分析方法系统地了解非编码RNA与间充质干细胞相关研究的发展趋势与关键领域。
方法：从Web of Science核心合集1990年至今的科学引文索引扩展获取非编码RNA与间充质干细胞相关研究的文献数据，运用VOSviewer和CiteSpace计量学软件对年份、国家或地区、研究机构、被引文献和关键词进行发文量、聚类、被引频次、突增性和中介中心性进行分析，揭示该研究领域的知识基础及前沿热点。
结果与结论： ①最终纳入5 348篇文献，发表在1997-2021年，相关文献呈现明显的增长趋势，尽管在2022年略有减少，其发文量仍保持较高水平；中国在该领域的研究中占据主导地位，其中上海交通大学为最活跃的机构。②对被引文献分析发现，高突增性、高中介中心性、高被引的文献主要与微小RNA、细胞外囊泡和骨代谢等内容相关，这些文献构成了非编码RNA与间充质干细胞研究领域的重要知识基础。③对关键词进行突增性分析发现，至今保持高突增性的关键词包括外泌体、环状RNA、细胞外囊泡和损伤。④对关键词进行聚类演变分析，发文量仍保持增长趋势的关键词聚类包括：肿瘤微环境、骨关节炎、氧化应激和细胞外囊泡，这些关键词反映了目前以及未来该领域的研究热点。⑤文章结果不仅展示了非编码RNA与间充质干细胞研究领域的研究态势，更重要的是有望为研究人员提供潜在的方向和启示。

https://orcid.org/0000-0003-3398-1434(周嘉欣)；https://orcid.org/0000-0001-9878-455X(陶疆)

中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程

关键词: 非编码RNA, 间充质干细胞, 计量学分析, 可视化分析, 热点前瞻, 知识基础, CiteSpace, 作用机制, 细胞外囊泡, 转化应用

Abstract: BACKGROUND: Non-coding RNA, as a class of RNA molecules that do not encode proteins, plays a crucial role in cellular regulation. Simultaneously, mesenchymal stem cells possess multipotent differentiation capabilities, making them vital for tissue repair and regeneration. In recent years, researchers have extensively explored the role of non-coding RNA in regulating the functions of mesenchymal stem cells.
OBJECTIVE: To systematically understand the trends and key areas of research related to non-coding RNA and mesenchymal stem cells through bibliometric analysis.
METHODS: Literature data on non-coding RNA and mesenchymal stem cell-related research were retrieved from the Science Citation Index Expanded in the Web of Science Core Collection from 1990 to the present. The literature data were analyzed using bibliometric tools such as VOSviewer and CiteSpace, focusing on publication output, clustering, citation frequency, burstiness, and intermediary centrality with respect to years, countries or regions, research institutions, cited references, and keywords. This analysis aimed to reveal the knowledge base and emerging hotspots in the research field.
RESULTS AND CONCLUSION: (1) This study included a total of 5 348 articles for analysis, showing a significant growth trend in relevant literature from 1997 to 2021. Although there was a slight decrease in 2022, the publication output remained at a high level. China dominated the research in this field, with Shanghai Jiao Tong University being the most active contributor. (2) Analysis of cited references revealed that highly bursty, intermediary, and cited articles were mainly related to topics such as microRNA, extracellular vesicles, and bone metabolism. These articles constitute an important knowledge base for research on non-coding RNA and mesenchymal stem cells. (3) Burstiness analysis of keywords identified persistent bursts in keywords such as exosomes, circular RNA, extracellular vesicles, and injury. (4) Cluster evolution analysis of keywords with continuous growth in publication output included clusters related to tumor microenvironment, osteoarthritis, oxidative stress, and extracellular vesicles. These keywords reflect the current and future research hotspots in the field. (5) The findings of this study not only illustrate the research trends in the field of non-coding RNA and mesenchymal stem cells but also provide potential directions and insights for researchers.

Key words: non-coding RNA, mesenchymal stem cell, bibliometric analysis, visual analysis, hotspot prospect, knowledge base, CiteSpace, action mechanism, extracellular vesicle, translational application

中图分类号:

周嘉欣, 陶疆. 非编码RNA与间充质干细胞研究的相关计量学分析[J]. 中国组织工程研究, 2025, 29(1): 87-94.

Zhou Jiaxin, Tao Jiang. A bibliometric analysis of non-coding RNA and mesenchymal stem cell research[J]. Chinese Journal of Tissue Engineering Research, 2025, 29(1): 87-94.

图/表（结果） 5

2.1 发文趋势分析结果 利用Web of Science核心集数据库检索关于非编码RNA与间充质干细胞研究相关的文献，文献数量共7 558篇，限定语言为英语且文章类型为“Article”后为5 848篇，使用CiteSpace6.2.R4软件进行查重，去除重复的500篇文献后，最后为5 348篇文献。最早的文献可追溯至1997年，1997-2023年的年发文量见图1A；2003-2011年的发文量呈指数增长趋势(R2=0.997 2)；2012-2021年，文献发文量继续增长，表现为线性增长趋势(R2=0.974 9)，2021年的年发文量最大，达729篇，2022年回落，2023年发文量未统计全年。按国家/地区统计累计发文量，共包括79个国家/地区，其中中国的累计发文量最大，占50.2%，为3 191篇，见图1B。
2.2 研究机构合作关系网络及贡献 据统计，共202个研究机构纳入分析。由VOSviewer 1.6.20软件生成机构合作网络图，见图2，每个节点为研究机构，节点大小与机构发文量呈正比，两节点连线表示机构间存在合作关系。其中，合作强度排名前3的机构依次为上海交通大学、中国医学科学院和南京医科大学，主要为中国机构间的合作，国际机构间的合作较少。按研究机构统计累计发文量，其中发文量排名前3的机构分别是上海交通大学(198篇)、中山大学(152篇)和南京医科大学(139篇)。
另外，计算了各个研究机构的中介中心性，见表1。中介中心性衡量了节点在网络中位置的重要性。中介中心性指的是一个节点(例如一个国家或一篇文章)在其他节点之间的最短路径上出现的次数[13]。中介中心性高( > 0.1)的节点被认为是关键枢纽，在网络图中被标记为紫色外圈。按中心性排名前3位的机构分别为俄亥俄大学系统(0.14)、韩国首尔大学(0.13)和加利福尼亚大学(0.12)。

2.3 共被引用网络及突增性分析结果 共被引用分析是一种用于评估文献之间相互关系的科学计量学方法。当2篇或多篇学术文献同时被后续文献引用，可视为共被引文献[14]。在共被引用网络图中，每一个节点代表一篇学术文献，节点的大小与该文献的被引用频率呈正比，节点的颜色表示文献的出版时间，两个节点之间的连线反映它们的共被引关系。
共被引网络图中呈现聚类模块规模排名前14的聚类模块，并以不同色块标志，见图3。采用模块度(modularity)和加权平均轮廓系数(Weighted mean silhouette)用来衡量网络被分割成不同模块或群集的质量和有效性[15]，这两个指标分别大于0.3和0.5，提示聚类效果理想[16]。文章中，共被引聚类中的模块度为0.859 3，意味着各个子领域可以被清晰地划定。加权平均轮廓系数为0.950 4，表明文章的聚类结果在聚类紧密度和分离度方面具有高度的质量和效果。聚类模块以“#0-#13”序号命名，序号越小表示该模块越大包含的文献量越多。其中，规模最大的聚类模块是骨关节炎(#0 osteoarthritis)，包含114篇文献，平均出版时间是2019年。
突增是指在某个时间段内，一篇文献被引频次或一个关键词出现频次快速增加，这通常表明该文献在该时间段内具有较高的学术影响力或者在研究领域中的重要性突然增加。突增有两个属性，分别是突增的强度和突增状态的持续时间。表2展示的是2年内被引突增最强的5篇文献[17-21]，其中突增强度最强的是学者ESKILDSEN等[17]在2011年于《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》发表的论文，揭示了miR-138抑制间充质干细胞成骨分化的机制。其中，有3篇文献划分为外泌体(#3 exosomes)聚类[17-19]，它们的主要内容都与微小RNA调控骨代谢相关。另外，国际细胞外囊泡学会[20]和KALLURI等[21]发表的2篇文章划分为成骨分化(#1 osteogenic differentiation)聚类，它们综述了细胞外囊泡的特性、功能、应用和研究规范等。这些文献说明骨代谢相关研究与外泌体研究密切相关。

表3显示了高中介中心性的文献[22-26]，且这些文献节点均位于聚类模块间，是连接网络中的个体节点以及连接聚类模块的重要节点。其中，中介中心性得分最高的是学者WANG 等[22]于2013年在《Nature Medicine》期刊上发表的论文，揭示miR-214抑制骨形成的机制，还有LI 等[23]于《Nature Communications》发表关于破骨细胞释放含miR-214-3p的外泌体抑制骨形成的文章，这2篇文章都位于外泌体(#3 exosomes)、微囊泡(#2 microvesicles)、细胞外囊泡(#5 extracellular vesicles)和长链非编码RNA(#9 long non-coding RNA)聚类模块交界处[22-23]，见图3，为多个研究方向提供知识基础。QI等[24]发表的人诱导多能干细胞来源间充质干细胞分泌的外泌体能促进骨再生的体内实验研究划分为骨关节炎(#0 osteoarthritis)聚类，但其也位于微囊泡(#2 microvesicles)和骨髓间充质干细胞(#10 bmscs)模块的边界处，该文献为对连接着多个方向的研究起到重要作用。同样，COLLINO 等[25]揭示成人骨髓和肝脏来源间充质干细胞分泌的微囊泡含特定miRNA的研究位于溶血磷脂酸(#7 lysophosphatidic acid)、长链非编码RNA(#9 long non-coding RNA)和表达谱(#4 expression profile)等聚类模块间，以及CHEN等[26]发表关于间充质干细胞通过分泌富含微小RNA前体的微囊泡来促进微小RNA介导的细胞间通信的研究位于表达谱(#4 expression profile)、细胞外囊泡(#5 extracellular vesicles)、软骨形成(#6 chondrogenesis)和长链非编码RNA(#9 long non-coding RNA)等聚类模块间[26]。

表4显示的是被引频次排名前5位的被引文献[17，20-21，27-28]，主要涉及细胞外囊泡研究的相关综述和指南。其中被引频次最高的是国际细胞外囊泡协会于《Journal of Extracellular Vesicles》期刊上发布的细胞外囊泡研究的要求指南。该指南对细胞外囊泡相关实验提出要求，涉及分离纯化、组分鉴定、功能研究等内容[20]。
2.4 关键词突增分析及研究方向演变 对819个关键词进行分析，图4展示了突增强度排名前20的关键词，其中直至2023年，仍然保持突增趋势的关键词分别为外泌体(exosome)、环状RNA (circular RNA)、细胞外囊泡(extracellular vesicles)及损伤(injury)，其中外泌体为细胞外囊泡的亚类。将关键词共现网络进行聚类分析，获得13个聚类，并以峰峦图呈现，见图5。峰峦图展示了各个研究方向随时间的演变。峰的高度表示该聚类在相应年份的发文量，反映了该研究方向的活跃水平，括号内为该研究方向直至2023年仍呈现突增趋势的关键词。近年来，成骨分化(#6 osteogenic differentiation)、成脂(#8 adipogenesis)和神经元分化(#9 neuronal differentiation)方向的研究热度明显降低。肿瘤微环境(#1 tumor microenvironment)、骨关节炎(#4 osteoarthritis)、氧化应激(#5 oxidative stress)、细胞外囊泡(#10 extracellular vesicles)等方向有较高的研究热度。

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引言

非编码RNA(non-coding RNA，ncRNA)是指在细胞中不被翻译为蛋白质的RNA分子，非编码RNA包括多个亚类。在20世纪50年代，核糖体RNA(rRNA)和转运RNA(tRNA)被发现在蛋白质合成过程中发挥重要作用[1]。在21世纪初，微小RNA(miRNA)被发现，揭示了其在基因表达过程中转录后调控的重要作用[2]。如今，随着深度测序技术的发展，越来越多的非编码RNA被发现，如长链非编码RNA(lncRNA)及环状RNA (circRNA)等，这些非编码RNA在许多生理和病理过程中扮演着重要的角色[3]。特别是在间充质干细胞中，非编码RNA调控细胞增殖、分化等生物学过程[4]，同时也为干细胞治疗提供潜在的调控策略[5]。间充质干细胞来源广泛，可从不同的人体组织中分离出来，且具有自我增殖和多向分化的特性[6]。越来越多的研究发现间充质干细胞具有治疗多种疾病的潜力，如心血管疾病、肿瘤和骨关节炎等[7-9]。间充质干细胞也被用于多种疾病的建模，研究某些疾病的病因和病理机制，以及验证治疗策略的有效性[10]。

近年来，研究者们对非编码RNA在调控间充质干细胞功能的研究中做出了许多贡献，然而却缺乏对这一研究领域的文献计量学分析。为了全面了解该领域的研究现状，作者采用了文献计量(Bibliometrics)分析方法对该研究领域进行探究。文献计量学分析和荟萃分析都是通过定量分析方法梳理既往的研究，这两者容易令人混淆。荟萃分析方法目的在于总结研究变量之间的关系证据，揭示研究变量间的关系，纳入的文献资料往往具有同质性。然而，文献计量学分析方法是通过系统地梳理大量文献计量数据，识别出研究领域的知识结构和新型热点，分析学科交叉与国际合作等关键因素[11]。
因此，文章的主要目的是通过文献计量学工具定量分析非编码RNA和间充质干细胞领域的研究模式和趋势，帮助研究者了解该研究领域的知识结构和研究前沿。
中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程

材料方法

1.1 数据资料 该研究的原始数据来源于Web of Science核心集1990年至今的科学引文索引扩展(Science Citation Index-Expand)，限定出版物语言为英语且文章类型为“Article”。检索策略为TS=((“Non-coding RNA *” OR ncRNA * OR “Ribosomal RNA*” OR rRNA* OR “Transfer RNA*” OR tRNA* OR “tRNA-derived fragment*” OR tRF* OR “Enhancer RNA*” OR eRNA* OR “PIWI-interacting RNA*” OR piRNA* OR “Small Nuclear RNA*” OR snRNA* OR “Small Nucleolar RNA*” OR snoRNA* OR “Circular RNA*” OR circRNA* OR “Long non-coding RNA*” OR lncRNA* OR “MicroRNA*” OR miRNA* OR “Small Interfering RNA*” OR siRNA*)) AND TS=((“Mesenchymal Stem Cell*” OR MSC* OR “Mesenchymal Stromal Cell*”))。
为避免数据库频繁更新造成偏差，检索在2023-11-08完成，并于当日以纯文本格式下载全部检索结果。另外，使用CiteSpace.6.2.R4软件(软件来源：citespace.podia.com)对下载的数据进行去重处理，获得的数据将用于后续分析。
1.2 方法
1.2.1 文献分布特征分析 首先，分析了文献的分布特征，统计发文量按时间、国家/地区以及研究机构的分布。使用VOSviewer 1.6.20软件先将发文量少于10篇的机构排除，将同一机构的名称进行统一合并，再计算生成机构合作网络图。另外，还使用了 CiteSpace 6.2.R4软件计算了每个研究机构的中介中心性。
1.2.2 共被引网络构建及聚类分析 运用CiteSpace 6.2.R4软件可视化文献共被引网络。为了挖掘文献中的不同研究主题和领域，使用CiteSpace 6.2.R4软件内置的谱聚类工具将网络划分为不同的聚类模块。谱聚类算法是根据连接节点的边来识别图中节点的群落[12]。并运用对数似然比算法分析施引文献的关键词从而生成聚类标签(P < 0.001)。另外，对被引文献进行突增性分析，分析在2年及以上时间内被引频率显著增加的文献，并计算其突增强度。
1.2.3 关键词突增及聚类演变分析 按1.2.2的方法对关键词进行突增性分析以及聚类。另外将每个关键词聚类以峰峦图的形式展示，可视化各个研究方向随时间的演变。
1.2.4 数据分析 使用Excel 2019(Microsoft)、VOSviewer 1.6.20和CiteSpace 6.2.R4软件进行数据分析及图表绘制。使用CiteSpace分析时，将 g 指数设置为k=25，并使用pathfinder进行网络剪枝，因涉及的时间内跨度较大，故将时间划分为2年/切片，其他参数为默认设置。

1.3 主要观察指标 观察指标包括发表年份、国家/地区、研究机构、被引文献和关键词。对于发表年份和国家/地区，进行发文量分析；对于研究机构，进行合作网络可视化、中介中心性分析和发文量分析；对于被引文献，进行聚类分析、突增性分析和中介中心性分析；对于关键词，进行突增性分析和聚类演变分析。

讨论

文献计量学的历史可追溯到20世纪初期，但近年来才得到快速的发展，这主要得益于信息技术的进步和大规模文献数据库的建立，使研究者能够更全面地分析和理解学术研究的动态[29]。特别是在生物医学领域，学术研究成果呈现爆发式的增长[30]，文献计量学分析让研究者快速了解研究领域并且探索研究前沿。然而，目前仍缺乏文献计量学研究对非编码RNA和间充质干细胞领域进行分析。为此，文章运用VOSviewer和CiteSpace可视化过去近27年间非编码RNA与间充质干细胞研究的发展，分析了国家及地区、研究机构和重要文献的影响，也探究了该研究领域的发展趋势及研究前沿。
3.1 非编码RNA与间充质干细胞研究的发文量趋势与贡献 自2003年开始，关于非编码RNA与间充质干细胞的研究文献快速增长，近2年发文量减缓，但仍然保持在较高水平。该研究领域的兴起与测序技术发展密不可分，特别是NGS(next generation sequencing)测序技术，广泛用于基因组测序、转录组测序及蛋白质-DNA相互作用等领域，以高通量、高速度和低成本的特点，迅速改变了生物学研究的面貌[31]。后来，单细胞测序技术的出现使得研究者能够在单个细胞水平上检测非编码RNA的表达，从而深刻认识非编码RNA在复杂组织和异质性细胞群中的关键作用[3]。在众多国家和地区中，中国发文量占绝对优势，说明中国十分重视非编码RNA与间充质干细胞的相关研究[32-33]。
在众多研究机构中，美国俄亥俄州大学体系的中介中心性最高。美国俄亥俄州大学体系是俄亥俄州的一个教育体系，包括多个大学和学院，该教育体系在2007年建立，旨在更好地协调和整合公立高等教育机构，有助于促进科学研究和知识交流，这也使得该机构在合作网络中占有重要的位置。该机构在心血管研究领域提出了重要见解，揭示了间充质干细胞在心脏保护及血管生成中的新机制，通过分泌携带微小RNA的外泌体和激活信号通路来提高心脏细胞的存活和促进内皮细胞的血管生成作用[34-35]。韩国首尔大学在合作网络中也十分重要，他们的研究揭示了间充质干细胞源性外泌体调控肿瘤微环境的机制[36]，以及间充质干细胞源性细胞外囊泡在自身免疫性疾病中的免疫调节作用[37]。中国上海交通大学发文量最大，涉及的研究方向众多，如肿瘤微环境、肺损伤修复及神经损伤修复研究等[38-40]，并且涉及材料学等多学科合作的研究[41-42]。
3.2 非编码RNA与间充质干细胞研究的知识基础 文献共被引网络可以帮助识别在特定研究领域中受到广泛关注的重要文献。文章重点关注3类被引文献，分别是高突增性、高中介中心和高被引的文献。其中被引突增性和中介中心性最高的文献分别是ESKILDSEN 等[17]于2011年和WANG等[22]于2013年发表的研究，他们都揭示了微小RNA对骨形成的作用，另外，这两个研究在聚类分析中都被划分为外泌体(#3 exosomes)，说明这是后续外泌体相关研究的知识基础。被引频次最高的是2018年国际细胞外囊泡学会发布的关于细胞外囊泡研究的指导原则和共识声明[20]，它对于标准化细胞外囊泡研究方法、报告和数据共享方面提出了指导意见。分析这些重要的被引文献发现它们主要涉及微小RNA、细胞外囊泡和骨代谢等方向，为研究人员探索该领域提供了重要的知识框架和基础。

3.3 非编码RNA与间充质干细胞研究的热点前瞻 为了发现非编码RNA与间充质干细胞研究领域的新兴趋势和热点，文章对关键词进行了突增分析。外泌体、细胞外囊泡、环状RNA、损伤这4个关键词直至2023年仍保持突增趋势，提示这是近期受到关注的研究方向。其中，外泌体和细胞外囊泡都属于细胞外囊泡方向，细胞外囊泡是由细胞分泌到细胞外的小囊泡，它们携带有生物分子，在细胞间通讯起到重要作用。另外作为生物标志物、药物递送系统及免疫治疗工具等，在临床应用方面引起了广泛关注[43]。细胞外囊泡是非编码RNA和间充质干细胞研究中重要的桥梁，无论是在早期的研究中还是近年来，它仍然备受关注。环状RNA是一类分子结构呈环状的非编码RNA。环状RNA可以通过结合微小RNA 并调节其活性，从而影响微小RNA 对其靶基因的调控作用[44-45]，这一发现推动了对环状RNA功能的深入研究。近年来，基于环状RNA的治疗应用也备受关注，环状RNA不仅可以作为疾病治疗的作用靶点[46]，更是一种有前景的治疗药物[47]。损伤可激活间充质干细胞参与组织修复，而非编码RNA可能在组织损伤和间充质干细胞修复功能之间进行调节，这种机制参与了多种损伤类型的修复，如肺损伤、肾脏损伤及视网膜损伤等[48-50]。
文章将关键词进行聚类分析，生成13个研究方向聚类，并分析它们随时间的变化。在研究早期，研究者主要关注于间充质干细胞分化方向(骨组织、脂肪组织和神经组织)以及机制相关的研究。如今，疾病的预防、诊断和治疗得到了更多的关注，特别是出现了涉及多学科的研究，多学科协作有助于解决研究及成果转化过程中的许多问题。在氧化应激研究方向中，出现了材料学方向的关键词水凝胶(hydrogel)。水凝胶是一类高度水合、具有三维网状结构的材料。水凝胶应用于疾病建模，更好地模拟人体生理和病理条件，提高实验结果重复率[51]。另外，水凝胶也可以解决干细胞移植和药物递送的相关问题[52-53]。在基因递送(gene delivery)方向，旨将 DNA 或 RNA 等外来遗传物质导入宿主细胞，是一种有潜力的治疗策略[54]。由于神经系统存在天然的屏障[55]，脊髓损伤 (spinal cord injury)的相关研究备受关注，这些研究通过各种策略(纳米材料和腺病毒等)递送小干扰RNA，以提高间充质干细胞修复损伤的治疗效果[56-58]。
3.4 文章的局限性 ①中国研究人员在该领域贡献突出，然而文章未纳入中文文献，这可能会使研究结果产生偏倚，未来的研究有必要对中文数据库进行检索。②该研究领域的文献数据量较大，尽管在数据分析之前已进行去重，也难以避免重复或无关的数据纳入。
3.5 总结与展望 这项研究采用计量学的方法对与非编码RNA和间充质干细胞相关的文献进行了分析，旨在深入探讨该领域的发展和研究前沿。在过去的27年中，该领域已经从功能机制研究逐步迈向临床转化，并经历了从缺乏研究工具到多学科合作的发展阶段，在此过程中，取得了显著的研究成果，并且中国在该领域的发文数量也处于领先地位。据分析，近年来的研究热点集中于细胞外囊泡、环状RNA、水凝胶、基因递送、肿瘤微环境以及各种组织的损伤修复等方面，为研究人员、资助申请者和资助机构提供了有价值的信息。
中国组织工程研究杂志出版内容重点：干细胞；骨髓干细胞；造血干细胞；脂肪干细胞；肿瘤干细胞；胚胎干细胞；脐带脐血干细胞；干细胞诱导；干细胞分化；组织工程

非编码RNA与间充质干细胞研究的相关计量学分析

A bibliometric analysis of non-coding RNA and mesenchymal stem cell research

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